Er bestaan veel verschillende kleuren. Deze kleuren zijn 'opgebouwd' uit verschillende genen. Alle ratjes hebben als basiskleur zwart (aa) of agouti (A_). Met de letters wordt de genetische code aangegeven. Een gen kan dominant of recessief zijn, dominant houdt in dat een dier maar één kopie van dat gen hoeft te krijgen om de kleur te tonen (agouti is bijvoorbeeld dominant over zwart, dit wordt dan ook aangegeven als A_, aangezien het niet uitmaakt of het tweede kopie een a of een A is. Zwart is recessief, een rat heeft twee genen - van beide ouders - nodig om het te zijn, dus aa). Een dominant gen wordt aangegeven met een hoofdletter, een recessief gen met een kleine letter.
Zwart
Genetisch: aa
Oogkleur: zwart
Omschrijving: Zowel de boven- als ondervacht zijn diepzwart. Een echte zwarte rat hoort geen zilvere haren door zijn vacht te hebben, maar de meeste zwarte ratten hebben dit wel. Dit wordt 'verzilveren' genoemd. Ook zie je bij veel zwarte ratten bruinige vlekken in de vacht, dit heeft 'verroesten'.
Fotomodel: Parzival's Phantom
Agouti
Genetisch: A_ (Aa of AA)
Oogkleur: zwart
Omschrijving: Agouti is de 'wildkleur' van ratjes. Het is een rijke, roodbruine kleur. Typisch voor agouti is de 'ticking', de uiteinden van de haren zijn zwart. De ondervacht is donkergrijs en de buik is zilvergrijs. Agouti komt in verschillende tinten, van grijsbruin tot diep roodbruin.
Fotomodel: Mustang
Mink
Genetisch: aa mm (zwart plus twee kopieën van het mink-gen)
Oogkleur: zwart
Omschrijving: Een grijs-bruine kleur, variërend van warmbruin tot vaalgrijs bruin. Mink hoort egaal van kleur te zijn, zonder verkleuringen. Toch zie je vaak roest- of zwartbruine vlekken in de vacht.
Fotomodel: Havyn's Couráge
Cinnamon
Genetisch: A_ mm (agouti plus twee kopieën van het mink-gen)
Oogkleur: zwart
Een warm roodbruin. Door de hele vacht is er een ticking, de punten van de vachtharen zijn chocolatebruin. De ondervacht is middengrijs en de buik is net als bij agouti zilvergrijs, maar dan lichter.
Fotomodel: Havyn's Camaro
Pearl
Genetisch: aa mm Pe (zwart met twee kopieën van het mink gen en één kopie van het pearl gen)
Oogkleur: zwart
Een lichte zilvere kleur. De ondervacht is crème, de punten van de vacht zijn grijs. Pearl bestaat in vele tinten, van heel licht zilver (bijna wit) tot donker grijsbruin.
Fotomodel: Havyn's Capri
Cinnamon Pearl
Genetisch: A_ mm Pe (agouti met twee kopieën van het mink gen en één kopie van het pearl gen)
Oogkleur: zwart
Een licht goudbruine kleur. De vacht bestaat uit drie banden van kleuren, bij de basis crème, dan blauwig en uiteindelijk oranje, met zilvere dekharen. De buik is licht zilvergrijs. Er zijn verschillende tinten, van heel licht goudbruin tot zo donker dat het bijna cinnamon lijkt.
Fotomodel: Darkstar Jaguar
Coffee
Genetisch: aa mm bb (zwart met twee kopieën van het mink gen en twee kopieën van het bruin - chocolate - gen)
Oogkleur: zwart
Een caramel of koffie-met-melk kleur. Het is warm bruin en lichter van kleur dan mink. Coffee komt erg weinig voor in Nederland, de eerste coffee's waarvan wij weten doken op in ons D-nestje.
Fotomodel: Havyn's Deebee Nine
Chocolate
Genetisch: aa bb (een zwarte rat met twee kopieën van het bruin/chocolate gen)
Oogkleur: zwart
Een diepe, chocolade bruine kleur. Niet te vergissen met een te lichte zwarte rat, chocolate heeft een duidelijke bruine tint. Het komt weinig voor in Nederland.
Fotomodel: Darkstar Jazz
Russisch Blauw
Genetisch: aa rbrb (zwart met twee kopieën van het Russisch blauw gen)
Oogkleur: zwart
Donker muisgrijs, met een staalblauwe glans. Dezelfde blauwe kleur als bij honden en katten gezien kan worden.
Fotomodel: Havyn's Audi
Amerikaans blauw
Genetisch: aa dd (zwart met twee kopieën van het Amerikaans blauw gen)
Oogkleur: zwart
Een zachte, warme grijsblauwe kleur. De ondervacht is lichter van kleur. Amerikaans blauw wordt (evenals silverblue) in verband gebracht met meer gezondheidsproblemen dan andere kleuren. Dit is ook de reden dat je deze kleur zelden ziet bij goede ratteries (wij hadden deze kleur in ons A-nestje, maar hadden dit niet verwacht).
Fotomodel: Havyn's Alvin van Kevin
Silverblue
Genetisch: aa dd rbrb (zwart met twee kopieën van het Russisch blauw gen en twee kopieën van het Amerikaans blauw gen)
Oogkleur: zwart
Een licht blauwgrijs. Silverblue wordt (evenals Amerikaans blauw) in verband gebracht met meer gezondheidsproblemen dan andere kleuren. Dit is ook de reden dat je deze kleur zelden ziet bij goede ratteries.
Fotomodel: Havyn's Ascari
Beige
Genetisch: aa rr (zwart met twee kopieën van het gen voor robijnrode ogen)
Oogkleur: Robijnrood
Omschrijving: Een warme, lichtbruine kleur.
Fotomodel: Reba's Anoki
Argente
Genetisch: A_ rr (agouti met twee kopieën van het gen voor robijnrode ogen)
Oogkleur: robijnrood
Een warme, goudbruine kleur, met een ticking van zilvere haren. Soms bijna oranje van kleur. De ondervacht is leiblauw/grijs en de buik zilvergrijs.
Fotomodel: Cira